Отдел научно обоснованного применения средств химизации является связующим звеном между организацией и непосредственно сельхозтоваропроизводителями через сеть районных агрохимиков, которые ведут не посредственную работу с агрономами и руководителями хозяйств всех форм собственности. Через районных агрохимиков передаются в с/х предприятия зоны – рекомендации, методические материалы, нормативы, акты и др. документы. Агрохимики ведут сбор оперативной и текущей информации по заданию Министерства сельского хозяйства.

Работа в отделе проводится по следующим направлениям:

- сбор и анализ оперативной информации по зоне обслуживания об использовании земель сельскохозяйственного назначения;

- установление оптимальных и экологически безопасных доз, сроков и способов внесения минеральных и органических удобрений;

- разработка проектно-сметной документации на известкование и гипсование;

- расчет потребности и составление плана применения удобрений на сельскохозяйственных культурах по отдельным предприятиям и фермерским хозяйствам;

- проведение комплексной диагностики минерального питания растений (почвенной и растительной) с установлением потребности и доз внесения удобрений;

- определение агрономической и экономической эффективности применения средств химизации в сельскохозяйственном производстве;

- проведение опытно-полевых и аналитических испытаний по установлению оптимальных и экологически безопасных доз внесения агрохимикатов.

- проводятся работы по мониторингу обрабатываемой пашни на участках длительного наблюдения для форм отчетности

Полевые опыты позволяют оценить плодородие почв, эффективность удобрений, вынос урожаем элементов питания и коэффициенты использования их, потери и в конечном итоге баланс элементов питания.

Отделом проводятся стационарные, кратковременные и производственные полевые опыты по изучению влияния минеральных и органических удобрений, биопрепаратов, стимуляторов роста, пестицидов и др. агрохимикатов на урожай и качество различных сельскохозяйственных культур выращиваемых в условиях Алтайского края. За многолетний период работы станцией было проведено более 700 опытов с агрохимикатами.
Особенное внимание уделялось изучению использование минеральных удобрений при основном и рядковом внесении в различных дозах сочетаний и агрохимических фонах под сахарную свеклу, яровую пшеницу и комовые культуры. Изучили особенности отзывчивости самых распространенных сортов яровой пшеницы на рядковое внесение удобрений в зависимости от предшественника, велось изучение действия минеральных удобрений в сочетании с навозом и дефекатом на урожайность сельскохозяйственных культур в звене севооборота. Изучалось влияние серосодержащих удобрений, биопрепаратов и комплексных минеральных и органоминеральных удобрений на урожай и качество яровой пшеницы и сахарной свеклы.

Конечная задача полевого опыта заключается в разработке рекомендаций по использованию минеральных удобрений в дозах с высокой экономической окупаемостью.